东方马型脑炎属虫媒病毒A组。其代表株为TenBroeck株。在电镜下病毒颗粒为球形RNA病毒，有囊膜，直径为40～60nm，对乙醚、甲醛紫外线、脱氧胆酸钠敏感。对胰酶不敏感。能凝集1天龄雏鸡和成年鹅红细胞。60℃加热10min即可灭活，－70℃可长期保存。病毒在pH5.1～5.7不稳。本病毒在鸡胚、地鼠肾、豚鼠肾、猴肾、鸭肾等组结培养下良好繁殖。对实验动物如小白鼠、豚鼠、鸡有较强的侵袭力和毒力。脑内接种和皮下接种可使许多鸟类和啮齿类动物发病。一些鸟类、啮齿动物、家畜、家禽均可感染。另在中美洲和南美一些地区还有一种东方马型脑炎病毒变异株，其抗原性与TenBroeck株有明显差异。该株可在马群中引起急性神经性疾病，而很少引起人类发病。

潜伏期7～10天。除一部分病人有前驱症状如倦怠、食欲缺乏、腹痛、咽痛、头痛外，临床经过分三个阶段。
1.初热期急性起病，突然出现寒战、高热，伴剧烈头痛，恶心呕吐，眼结膜炎等症状，体温很快升至39℃以上，持续2～3天，稍下降，然后再上升进入极期。
2.极期主要表现为持续高热(40℃以上)和明显中枢神经系统症状、体征。病人有剧烈头痛、呕吐、肌张力增强，谵妄或嗜睡，很快进入昏迷或惊厥。颈项强直明显，凯尔尼格征阳性，腹壁反射和提睾反射消失，四肢肌肉痉挛，部分病人表现麻痹。部分病人有眼肌麻痹，眼睑下垂、偏视。病重者因严重脑水肿发展成脑疝，引起呼吸不规则，直至呼吸心跳停止。也可因合并肺感染而死亡。死亡多发生在病后2周内。此期一般持续7～8天。
3.恢复期病程约10天后，体温开始下降，各种症状逐渐改善和恢复，病重者发热持续时间要长一些。通常遗留有语言障碍、嗜睡状、定向力差，对周围事物漠不关心或步态失调等。脑神经和支配四肢肌肉的神经麻痹者，多为永久性损害。

本病尚无特效治疗方法，仍以支持疗法和对症处理为主。对高热、惊厥、呼吸衰竭的抢救措施同流行性乙型脑炎。如能及时处理，多数病人可顺利度过极期而恢复。

预后：本病在美洲为最严重脑炎,死率约50%，幼儿预后差，老年人死亡率高。常留有后遗症。
预防：
1.防蚊和灭蚊是预防本病重要环节。
2.预防接种目前使用单价(东方马型脑炎)疫苗、双价(东马加西马)疫苗和三价(东马、西马和委内瑞拉马脑炎)疫苗，对马等家畜有较好的保护作用。目前人群疫苗接种，尚处在实验阶段。使用恢复期血清，对人群有一定的保护作用和治疗作用。