结肠小袋纤毛虫首先由Malmsten 于1857 年在2 例急性痢疾患者粪便中发现，随后Leu Kart 在1861 年在猪大肠中同样发现本虫。1862 年，Stein 将其归入小袋属并命名为结肠小袋纤毛虫，其分类学地位为原生动物亚界，纤毛门，动基裂纲，前庭亚纲，毛口目，毛口亚目，小袋属，结肠小袋纤毛虫(Balantidium
coli)。
1.形态 结肠小袋纤毛虫是目前发现惟一寄生于人体的纤毛虫，也是寄生在人体中最大的一种原虫。其生活史包括滋养体和包囊两种基本形态。
(1)滋养体圆形或卵圆形，无色透明或淡灰略带绿色，大小约(30～200)μm×(25～120)μm。腹面略扁平，背面隆起。虫体表面有嵴状隆起和沟状凹陷，自前方伸向后端。嵴状隆起表面有皱褶，沟状凹陷即位于两嵴之间。体表纤毛均从小沟伸向体外，纤毛摆动可使虫体前后运动。虫体表面有表膜覆盖，下方为透明的外质，内侧为内质。虫体前端略尖，其腹面有一个由表膜内陷形成的食物泡，食物在泡内消化，残余物质通过虫体后端小而不明显的三角形胞肛排出体外。滋养体有电子致密小体。胞质中还有两个伸缩泡(contractile vacuole)可调节渗透压。胞质中还含有多糖颗粒、食物泡等。线粒体分布在虫体外周。
(2)包囊圆形或卵圆形，大小约40～60μm。囊壁厚而透明，淡黄色或浅绿色。新鲜包囊内可见活动的滋养体。包囊对外界环境有较强的抵抗力，在室温下可活2 星期至2 个月，在直射阳光下经3h 后才死亡；对于化学药物的抵抗力也较强，在10%甲醛溶液中能活4h。
2.生活史 包囊为本虫的感染阶段。人因吞食被包囊污染的食物或饮水而感染。包囊在消化道受消化液作用，虫体脱囊而出转变为滋养体。滋养体落入大肠，以肠内食物残渣、肠壁细胞和细菌为食料。滋养体在肠道内主要以横二分裂法繁殖，也可以芽生殖法繁殖。部分滋养体受粪便成形的失水影响，虫体变圆分泌囊壁包绕虫体，形成包囊并随粪便排出。猪肠腔内滋养体可大量成囊，但人肠腔内则很少成囊。此外，虫体在成囊时核不分裂，故在消化道脱囊时，一个包囊只能产生一个滋养体。

结肠小袋纤毛虫感染后多数人并无症状，发病者不足1/5，临床表现可分为急性和慢性两型。
1.急性型 起病急骤。腹泻明显，每天数次或十余次，严重者可达数十次之多。大便有黏液或脓血，但多无阿米巴痢疾的腥臭味。腹痛常见并伴有里急后重，脐周或双下腹有压痛。患者多有不规则发热、恶心呕吐、乏力及食欲减退。严重患者可导致脱水、营养不良及消瘦，偶可导致肠穿孔。本型病程较短，往往不治自愈。
2.慢性型 起病隐匿，以反复发作的腹泻为主要表现，病程可长达数月至数年，并呈周期性发作，常因劳累、受凉、饮酒或进食脂肪食物而诱发。大便每天数次，多为糊状或水样，有黏液但脓血少见。少数患者表现为腹泻与便秘交替。患者多伴有腹胀，阵发性腹痛，肠鸣音活跃，双下腹压痛等。病程长者可有消瘦、贫血、体重下降、易激动、失眠等。

一般治疗原则上与其他肠道传染病相同。病原治疗首选甲硝唑，可获满意疗效。用量成人0.4～0.6g/次，3 次/d，口服，连用5～10 天。甲硝唑可使虫体胞膜破溃，核崩解直至消失。一般服药24～72h 后粪便中虫体即消失，症状逐渐好转，疗程结束时疗效可达90%～100%。亦可选用四环素、喹碘方、巴龙霉素等，但疗效均不如甲硝唑。

预后：本型病程较短，往往不能自愈。
预防：本病经口传播，故应强调注意饮食卫生和个人卫生，加强人、猪粪便管理，避免猪粪污染食物及水源，积极治疗病猪等。结肠小袋纤毛虫包囊对外界环境抵抗力较强，室温下可存活2 周，潮湿环境中可存活2～3 个月，在10%甲醛溶液中亦能存活4h，故对患者或病猪粪便无害化处理对控制本病流行尤为重要。