前列腺囊肿先天性者发生于中肾管或副中肾管系统的残余部分，囊壁由纤维肌组织构成；后天性囊肿多由于前列腺腺泡不完全梗阻形成潴留性囊肿，腺泡上皮变薄，囊肿壁为由立方上皮覆盖的纤维肌组织，囊液为黏液，可有精子。

患者的症状依囊肿的大小而不同，轻者可完全无症状，重者可表现有尿急尿频，排尿费力，尿线细，残余尿多及尿潴留，血尿极少见，囊肿内并发感染时，可出现脓尿。

较小囊肿无症状者可随诊观察，亦可经会阴或直肠穿刺抽吸，但易感染和复发；较大囊肿经耻骨后或经会阴手术切除，对于突入膀胱之囊肿，可经膀胱手术切除或经尿道电切，去除大部分囊肿顶部，使其充分引流。