病因尚未明了，可能与下列因素有关:
1.空泡化不全学说胚胎在6周时消化道增长的速度快于整个胚胎。消化道
长度的迅速增长首先是依靠腔内上皮细胞的增殖，致使某些部位的管腔狭窄或闭塞，成为实性索状体。正常情况下，上皮细胞分泌的液体聚集于细胞间形成空泡。这些空泡沿消化道纵行排列，然后相互融合或与主要管腔相通，当所有的上皮细胞被拉开而被覆于增长的消化道表面时，所有空泡最终完全放入空腔，完成消化道的增长。如果在空泡化期一组细胞相互融合但不与消化道相通时，则形成囊性变畸形。双胃也是空泡化不全形成的。
2.外胚层与内胚层粘连学说McLetchie提出，消化道畸形的发生与胚胎3
周时发育障碍，内胚层与外胚层发生异常粘连有关。当时，正是脊索形成阶段，脊索首先分裂成两段，通过两段间的孔道，内、外胚层发生粘连。这样，在外皮与消化管之间穿过脊髓与椎体，形成神经―肠管。在以后的发育过程中，神经―肠管通过分化或完全存留或残留一部分而形成各种不同的重复畸形。

大多数病人在出生后2年内出现间隙性呕吐，呕吐物多为胃内容物及未消化食物。此外，还有食欲差、上腹不适、钝痛、贫血、体重下降和营养不良等症状。如果有异位胰腺的导管与双胃相通，表现为反复发作的胰腺炎，若双胃发生溃疡，此时血液可经异位胰腺的导管进入肠道，出现黑便或上消化道出血的症状。腹部检查通常可在上腹部扪及囊性肿块，该肿块位置较表浅且或移动。

双胃诊断明了后，应及时手术治疗。通常采用的方法是将双胃连同共用的胃壁切除，再行胃壁吻合，该方法实用可靠，并发症少。另外还可施行胃部分切除术。对于合并异位胰腺、双胃与异位胰腺导管甚至与正常胰腺导管相通的病例，应切除异位胰腺，并在近正常胰腺外切断其通道，才能防止胰腺炎的复发。

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