最常见的致病菌有表皮葡萄球菌和金黄色葡萄球菌，其他常见的革兰阳性球菌还有肺炎球菌、链球菌和革兰阴性球菌、流感嗜血杆菌和莫拉菌。流感嗜血杆菌是儿童急性结膜炎中最常见的致病菌，正常情况下可存在于成年人的上呼吸道。细菌可通过多种媒介造成接触传染，如手、毛巾、水等，在公共场所，集体单位如学校、幼儿园及家庭中迅速蔓延，导致流行，尤以春季为甚。在各种呼吸道疾病流行时，致病菌也可通过呼吸道分泌物飞沫传播。

起病急，自觉异物感、灼热感、疼痛，严重时有眼睑沉重，畏光、流泪。有时因分泌物附着在角膜表面，造成暂时性视物不清，去除分泌物后即可恢复视力。由于炎症刺激产生大量黏液脓性分泌物，患者晨起时上、下睑可被分泌物粘在一起，难以睁开。当病变侵及角膜时，畏光、疼痛等症状明显加重，依角膜病变的情况可出现轻度的视力减退。
眼部检查可见眼睑肿胀、结膜充血，以睑部及穹隆部结膜最为显著。同时可伴乳头增生，结膜表面有脓性或黏液脓性分泌物，严重时可形成假膜，所以又称假膜性结膜炎。球结膜充血、水肿，有时甚至可突出于睑裂外。本病常双眼同时或相隔1～2 天发病。一般来说，发病3～4 天，病情达到高峰，随后逐渐减轻，10～14 天即可痊愈。

根据不同的病原菌选用敏感的抗菌药物点眼。在未作细菌培养的情况下，原则上应选用广谱抗菌药物，选择兼顾革兰阳性菌和阴性菌的两种抗菌药物联合用药，效果更佳。对分泌物多的患者，给药前应清除分泌物，可用4%硼酸溶液或生理盐水冲洗结膜囊或蘸取上述溶液的消毒棉棒清洁眼部。有假膜者，可用生理盐水棉棒将其除去，然后再滴眼药水。早期治疗应频繁点眼，每15 分钟1 次，连续2h，然后改为每小时1 次，连续24～48h，随后酌情减量，睡前涂抗菌药物眼膏，直至分泌物消失。对并发角膜炎者，应按角膜炎处理。目前临床较常用的抗菌药物包括：
1.喹诺酮类药物 包括诺氟沙星、氧氟沙星、环丙沙星、洛美沙星等，是广谱抗菌药物，对绝大多数革兰阴性菌包括铜绿假单胞菌都有很强的抗菌作用，对革兰阳性菌也有效。最近的研究发现，左旋氧氟沙星的敏感性更高、耐药菌株更少。此类药物毒性小，作用时间长，局部用药浓度通常是0.3%。
2.氨基糖苷类抗菌药物 目前最常用的是0.3%妥布霉素。由于耐药菌株的增加，庆大霉素已不作为首选用药。大量用药应注意药物毒副作用。
3.多肽类抗菌药物 常用药物为杆菌肽和多黏菌素B。杆菌肽主要用于革兰阳性菌及耐药金黄色葡萄球菌引起的炎症，滴眼浓度为100～500U/ml。多黏菌素B 对绝大多数革兰阴性杆菌有高度的抗菌作用，滴眼浓度1～2.5mg/ml。
4.抗菌药物混合制剂 由两种或多种抗菌药物混合，兼顾革兰阳性菌和阴性菌，如Meospotin(新霉素＋短杆菌肽＋杆菌肽)、Polyfax(多黏菌素＋杆菌肽)、Polytrim(多黏菌素＋三甲氧苄氨嘧啶)。
5.抗菌药物眼膏 与眼药水相比，眼膏中的药物浓度高，作用时间长，由于涂抹后可能引起视物模糊，因而白天应用受到限制。睡前应用眼膏，可使药物在结膜囊内保留较长时间，以提供较长的药物作用时间。常用的眼膏有：0.5%四环素、0.5%红霉素、0.3%妥布霉素和0.3%氧氟沙星等。

预后：一般的急性细菌性结膜炎具有自限性，病程历时10～14 天。治疗可使病程缩短1～3 天，但葡萄球菌性结膜炎可转为慢性。
预防：本病虽然预后良好，但传染性很强，易造成广泛流行，所以预防工作十分重要，一旦发现患者，应严加消毒隔离，切断各种可能的传播途径。医务人员为病人检查及治疗后，应注意防止交叉感染。